Retracer les taux de transmission et les origines des souches de SRAS-CoV-2 circulant au Brésil

Une importante équipe internationale de chercheurs a mené une étude visant à retracer les taux de transmission et l’origine des principales souches de SRAS-CoV-2 circulant actuellement au Brésil. Dans leur article publié dans la revue Science, le groupe présente sa stratégie et ce qu’il a appris sur la progression du COVID-19 au Brésil.

Le Brésil, comme les États-Unis, a adopté une approche pratique pour faire face à la pandémie de COVID-19. Comme les États-Unis, le pays a un leader qui n’a pas fait pression pour des stratégies connues pour ralentir la propagation du virus, telles que le port de masques, l’auto-isolement et la distanciation sociale. Le résultat a été l’une des épidémies à la croissance la plus rapide au monde, juste derrière les États-Unis. Dans ce nouvel effort, les chercheurs ont cherché à en savoir plus sur les taux de transmission et les souches particulières de SRAS-CoV-2 infectant les personnes au Brésil.

Les chercheurs notent que les efforts initiaux pour ralentir la propagation du virus au Brésil semblaient être efficaces, grâce aux efforts des dirigeants locaux – mais à mesure que le virus se propageait dans d’autres régions du pays, l’épidémie a pris de l’ampleur. Pour en savoir plus sur le virus et pourquoi il a pu se propager si rapidement, les chercheurs ont utilisé divers outils. L’une des premières a été l’analyse des données provenant de sources à travers le pays qui décrivaient la mobilité des infections, les taux d’infection et les décès. Ils incluaient également les décès non signalés comme dus au COVID-19, mais vraisemblablement – la plupart étaient simplement qualifiés d’infections respiratoires aiguës sévères. Dans cette partie de l’étude, ils ont utilisé les données pour créer des simulations de modèles. Et les simulations du modèle ont montré que la fermeture des magasins et des écoles dans les points chauds ralentissait la propagation du virus. L’ignorer, en revanche, ne l’a pas fait.

Une autre partie du travail consistait à examiner la voie de l’infection au Brésil. Dans cet effort, les chercheurs ont effectué des tests PCR sur des échantillons de tissus de 26 732 personnes à travers le pays. Ce faisant, ils ont constaté qu’environ 29% de tous les échantillons testés étaient positifs pour le COVID-19. Ils ont également trouvé plus de 100 souches du virus SARS-CoV-2. Une étude plus approfondie a montré qu’environ 75% des souches identifiées appartenaient à trois clades principaux, tous originaires d’Europe. Les chercheurs suggèrent que c’est probablement une augmentation des vols longue distance qui a permis au virus de se propager si largement et rapidement à travers le pays. Ils concluent en suggérant que le Brésil doit travailler plus dur sur les interventions non pharmaceutiques pour ralentir la propagation du virus.

© 2020 Réseau Science X